《应用数学学报》（双月刊）创刊于1976年，是中国数学会、中国科学院数学与系统科学研究院主办的中国一流的学术刊物。主要刊登国内外应用数学及相关领域的有关理论、方法和应用方面的研究论文，报道国内外应用数学各学科的发展动态及相关综合评论。

《系统科学与数学》（月刊）创刊于1981年，是由中国科学院主管、中国科学院数学与系统科学研究院主办的学报类月刊。主要刊登系统科学及其有关的数学、交叉科学、工程应用等方面在理论和方法上具有创造性的学术论文; 创造性地解决实际问题的科学技术报告以及重要学术动态的报道。

《数学学报》（双月刊）创刊于1936年，是由中国科学院数学与系统科学院数学所和中国数学会主办的数学专业学术期刊。是中国数学会最早的刊物，也是中国的第一个数学期刊。主要刊登纯粹数学和应用数学方面具有独创性的优秀成果性论文，例如代数，数论，分析，偏微分方程，几何，概率论等。

《运筹学学报（中英文）》（季刊）创刊于1997年，是由中国科学技术协会主管、中国运筹学会主办的国内唯一的一份全面刊载运筹学各方面的学术性刊物。主要刊登运筹学领域的理论研究和应用论文、综述文章、应用成果等。

《计算数学》（季刊）创刊于1964年，是由中国科学院主管、中国科学院数学与系统科学研究院主办的数值计算的理论、分析及其应用的学术性刊物。主要栏目：青年评述、论文等。

《密码学报（中英文）》（双月刊）创刊于2014年，由中国密码学会、北京信息科学技术研究院、中国科学技术出版社有限公司主办。主要刊载密码及相关领域的理论及应用最新研究成果、学术动态及发展趋势。内容涵盖密码学及信息安全理论和应用的各个方面。主要包括：密码学基础（数学、信息论、计算机科学等）、对称密码学（分组密码、序列密码、HASH函数、MAC码等）、公钥密码学、数字签名与身份认证、安全协议、密码应用、信息安全理论与应用等。

《代数集刊（英文版）》（Algebra Colloquium）（季刊），是创刊于1994年的中国主办的第一本国际性代数学期刊，2004年起由中国科学院数学与系统科学研究院与苏州大学合办的英文版数学刊物，在国内外学术界具有较大影响。期刊为英文季刊，每年3月、6月、9月、12月出版。

《计算数学（英文版）》（Journal of Computational Mathematics）（双月刊），创刊于1983年，由中国科学院主管、中科院数学与系统科学研究院主办。是关于数值计算理论、分析及应用的学术期刊。办刊宗旨是交流计算数学的研究成果，促进学科发展，为科学技术工程领域开辟新的研究途径，为科学技术进步做出贡献。

《数学年刊B辑（英文版）》（双月刊）（Chinese Annals of Mathematics. Series B）创刊于1983年，是由教育部主管、复旦大学主办的面向国内外的综合性的数学刊物。主要刊登：主要用英文刊登纯粹数学和应用数学两方面具有创造性的学术论文，其中包括几何、拓扑、代数、偏微分方程、常微分方程、控制论等。

《数学与统计通讯（英文）》（CommunicationsinMathematicsandStatistics）（季刊），创刊于2013年，是由中国科学技术大学主办，中科大数学科学学院承办，由德国施普林格出版社负责出版和全球发行的综合性数学与统计方向的英文刊（SCI收录刊源），主要发表基础数学、应用数学、计算数学、概率与统计等领域的高水平原创性研究论文(包括高水平的综述文章)。期刊致力于为中国数学研究各领域的工作者构建交流和共享的平台，帮助相关领域学者在世界范围内发出自己的声音并获取前沿信息，其宗旨是反映全球研究院所、高等院校等机构在数学与统计学科各研究领域的最新研究成果和动态。